Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PolkQ9QUG2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolkQ9QUG2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms