Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms