Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms