Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms