Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms