Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsmQ9JL96 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsmQ9JL96 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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