Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gde1Q9JL56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms