Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tfr2Q9JKX3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tfr2Q9JKX3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms