Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms