Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx3Q9JKB3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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