Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms