Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msgn1Q9JK54 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms