Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra4Q9JJT2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms