Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms