Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms