Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms