Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igdcc4Q9EQS9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms