Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgap1Q9EPJ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms