Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms