Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms