Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms