Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms