Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DA42 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DA42 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DA42 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms