Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms