Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms