Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms