Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms