Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms