Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms