Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms