Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap53Q9D439 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms