Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms