Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms