Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsig1Q9D2J4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsig1Q9D2J4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms