Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms