Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms