Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms