Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms