Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsfl1cQ9CZ44 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsfl1cQ9CZ44 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms