Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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