Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrs1Q9CYH6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms