Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd8Q9CX56 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms