Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf1Q9CWX2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms