Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWS4

Ints11, Integrator complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ints11Q9CWS4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ints11Q9CWS4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ints11Q9CWS4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms