Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok2Q9CQS5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok2Q9CQS5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms