Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQM1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms