Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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RTRAFQ9CQE8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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RTRAFQ9CQE8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RTRAFQ9CQE8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RTRAFQ9CQE8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RTRAFQ9CQE8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RTRAFQ9CQE8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RTRAFQ9CQE8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTRAFQ9CQE8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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