Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClpsQ9CQC2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms