Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp2Q9CQ73 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms