Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg3Q9CPX6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms